どうもみむらです。
Win8 にしてから、こいつだけがどーも。

ってことで、 2ch で見つけたのでぺたり。

引用元 : http://anago.2ch.net/test/read.cgi/software/1358044631/61

61 ：名無しさん＠お腹いっぱい。：2013/01/17(木) 03:33:02.35 ID:um2ykaLB0

これもテンプレに入れるべきじゃね？
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アプリケーションによって入力モードが変化する不具合の解消方法
1. ATOKのメニューから「プロパティ（環境設定）」を起動。
2. 左側の「設定項目」の「入力補助」から「特殊」を選ぶ。
3. 右側の「設定一覧」から「「アプリケーションからのモード変更を無視する」にチェックを入れる。
4. 「OK」ボタンを押す。
原因：
アプリケーションには指定する入力モードが設定されている為。
他社はこれを臨機応変に対応しているのだが、
ATOKは律儀に守っているためこの不具合が発生するので、
設定モードで解除剃る必要がある。
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このへんいじるとどうやら直るっぽいので、ちょっと試してみる。